Urodził się 28 kwietnia 1944 roku w Bad Kreuznach. Studiował historię, socjologię oraz nauki polityczne w Kolonii i Bonn. Zanim rozpoczął karierę polityczną był kierownikiem wydziału public relations w Federalnym Ministerstwie Spraw Wewnętrznych oraz działu analiz i informacji Federalnego Ministerstwa Spraw Zagranicznych. W Partii Wolnych Demokratów (FDP) pełnił funkcję federalnego przewodniczącego i sekretarza generalnego.

W 1982 roku wstąpił do Socjaldemokratycznej Partii Niemiec (SPD), a w 1983 roku został deputowanym do Bundestagu. W SPD pełnił funkcję rzecznika zarządu krajowego, redaktora naczelnego „Vorwärts” – organu prasowego SPD, sekretarza generalnego oraz zastępcy prezesa parlamentarnej frakcji w Bundestagu. W 1992 roku został przewodniczącym Komitetu ds. Unii Europejskiej Bundestagu, który przygotowywał ratyfikację traktatu w Maastricht. W latach 90., jako członek parlamentarnego Komitetu Spraw Zagranicznych, aktywnie angażował się w niemiecką politykę, w szczególności wobec krajów Europy Środkowej i Wschodniej.

W 1997 roku został przewodniczącym Rady do spraw Pokoju, Bezpieczeństwa i Rozbrojenia Międzynarodówki Socjalistycznej. W 1998 roku kanclerz Gerhard Schröder powołał go na stanowisko ministra stanu do spraw europejskich w Federalnym Ministerstwie Spraw Zagranicznych. W tym czasie Günter Verheugen odgrywał główną rolę w kształtowaniu niemieckiej polityki europejskiej, w szczególności w trakcie niemieckiej prezydencji, kiedy osiągnięto porozumienie w sprawie struktury finansów UE w latach 2000–2006.

We wrześniu 1999 roku Günter Verheugen został członkiem Komisji Europejskiej do spraw rozszerzenia. W tym czasie dał się poznać jako wiarygodny partner i przyjaciel Polski oraz innych krajów kandydujących. Był inicjatorem wielu rozwiązań negocjacyjnych, a po zakończeniu negocjacji rozszerzeniowych osobiście zaangażował się w kampanię przedreferendalną we wszystkich krajach przystępujących do UE. Będąc obecnie odpowiedzialnym również za rozwój polityki wobec nowego sąsiedztwa i poszczególnych krajów sąsiadujących z rozszerzoną UE, Günter Verheugen nadal odgrywa kluczową rolę w procesie integracji kontynentu europejskiego.

W 2002 otrzymał od tygodnika Wprost tytuł "Człowieka Roku 2002" Tytuł ten otrzymują osoby, które wywarły największy wpływ na rzeczywistość gospodarczą, społeczną i polityczną minionego roku